Antes de fazer a atualização NUNCA se esqueça de fazer um BACKUP!

Se tiver personalizações “extra” Koha tem que testa-las para saber se são compatíveis. Caso não sejam, terá que altera-las de modo a que fiquem.

sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade

Por vezes, quando há muitas alterações, é necessário fazer:

sudo apt-get install koha-common

Normalmente, quando acedemos à parte do staff, é detetada uma nova versão da BD e é atualizada, mas podemos forçar:

sudo koha-upgrade-schema {instancia}

Também poderemos forçar uma nova reindexação para corrigir erro que venham de trás:
koha-rebuild-zebra -v -f {instancia}

NOTAS:

Este é o repositório em oficial, em /etc/apt/sources.list.d/koha.list:
deb http://debian.koha-community.org/koha stable main

Caso queiramos fixar uma versão especifica dos repositórios poderemos indicar essa versão fazendo a alteração:
deb http://debian.koha-community.org/koha <version> main